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青年龙（沈震轩 饰）和女友敏（庄思敏 饰）、好友强（陆骏光 饰）和芬（曾淑雅 饰）合伙开了一家电脑软件公司，但是经营一年公司毫无进项。阿龙被高利贷逼得无处藏身，阿强恼羞成怒要和阿龙拆伙，小敏身怀有孕，却苦于现状打算断掉和孩子的这份缘分。正当他们的关系濒临崩溃之际，打扮考究的黄太（鲍起静 饰）找上门来，她声称儿子曾开发一款碟仙软件，但在完成前夕车祸去世。黄太儿子称这款软件能赚大钱，为了完成儿子的心愿，她找到阿龙等人聘请他们继续完成这款邪门的软件。 看在钱的份上，这几个年轻人结下了黄太的生意。与此同时，各种诡异离奇而恐怖的事件在他们身上发生……。照常进行修业之旅的小智（松本梨香 配音）、小刚（上田祐司 配音）、小霞（饭塚雅弓 配音）一行辗转来到水之都奥多马雷参加紧张刺激的水上竞赛。奥多马雷流传着一个精彩的传说，在很久很久以前，岛上的老夫妇捡到一对孤儿兄妹，当邪魔出现时，两兄妹化作威力强大的神奇宝贝拉帝欧斯和拉帝亚斯，他们击败邪魔，并赐予奥多马雷人民名为“心灵水滴”的宝石作为守护。时至今日，神圣的心灵之滴却引起一对盗贼姐妹（释由美子 配音）的垂涎。她们在追踪妹妹拉帝亚斯（折笠富美子 配音）时遭遇小智并受挫，贪欲将带给水都史无前例的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第五部电影剧场版。。